CV. Cruce mínimo entre mutaciones asociadas con la variante Ómicron de los epítopos de células T del SARS-CoV-2 y CD8+ identificados en individuos convalecientes de COVID-19

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Andrew Redd, et al. doi: https://doi.org/10.1101/2021.12.06.471446

Recopilado por Carlos Cabrera Lozada. Miembro Correspondiente Nacional, ANM puesto 16. ORCID: 0000-0002-3133-5183. 10/12/2021

Resumen

Existe una creciente preocupación de que la evolución en curso del SARS-CoV-2 pueda conducir a variantes de preocupación (COV) que sean capaces de evitar parte o la totalidad de la respuesta inmune multifacética generada tanto por la infección previa como por la vacunación, siendo de particular interés el VOC B.1.1.529 (Omicron) recientemente descrito. Se seleccionaron muestras de células mononucleares de sangre periférica de pacientes convalecientes de COVID-19 recuperados y confirmados por PCR (n = 30) infectados con SARS-CoV-2 en los Estados Unidos recolectadas en abril y mayo de 2020 que poseían al menos uno o más de seis haplotipos HLA diferentes para el examen de sus respuestas de células T CD8 + anti-SARS-CoV-2 utilizando un enfoque de tinción de tetrámeros multiplexados de péptidos-MHC. Este análisis examinó si los epítopos virales previamente identificados dirigidos por células T CD8 + en estos individuos (n = 52 epítopos distintos) están mutados en el VOC Omicron recientemente descrito (n = 50 mutaciones). Dentro de esta población, solo un epítopo de baja prevalencia de la proteína Spike se restringió a dos alelos HLA y se encontró en 2/30 (7%) individuos contenía un solo cambio de aminoácido asociado con el VOC de Omicron. Estos datos sugieren que prácticamente todos los individuos con respuestas existentes de células T CD8+ anti-SARS-CoV-2 deben reconocer el COV de Omicron, y que el SARS-CoV-2 no ha desarrollado mutaciones extensas de escape de células T en este momento.

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