CV. La capacidad de codificación del SARS-CoV-2. Nature, 09/01/2021

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El síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2) es la causa de la pandemia de la enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19) en curso1. Para comprender la patogenicidad y el potencial antigénico del SARS-CoV-2 y desarrollar herramientas terapéuticas, es esencial perfilar el repertorio completo de sus proteínas expresadas. El mapa actual de la capacidad de codificación del SARS-CoV-2 se basa en predicciones computacionales y se fundamenta en la homología con otros coronavirus. Como el complemento proteico varía entre los coronavirus, especialmente en lo que respecta a la variedad de proteínas accesorias, es crucial caracterizar el rango específico de proteínas del SARS-CoV-2 de una manera no sesgada y abierta. Aquí, utilizando un conjunto de técnicas de perfilado de ribosomas, presentamos un mapa de alta resolución de regiones codificantes en el genoma del SARS-CoV-2, que nos permite cuantificar con precisión la expresión de marcos de lectura abiertos virales canónicos (ORFs ) y para identificar 23 ORF virales no anotados. Estos ORF incluyen ORF corriente arriba que probablemente tengan un papel regulador, varios ORF internos en marco dentro de los ORF existentes, lo que da como resultado productos truncados N-terminales, así como ORF internos fuera del marco, que generan nuevos polipéptidos. Además, mostramos que los ARNm virales no se traducen de manera más eficiente que los ARNm del huésped; en cambio, la traducción de virus domina la traducción del huésped debido a los altos niveles de transcripciones virales. Nuestro trabajo proporciona un recurso que formará la base de futuros estudios funcionales.

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