CV. Mutaciones recurrentes de SARS-CoV-2 en pacientes inmunodeficientes

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Sam AJ Wilkinson, et al. doi: https://doi.org/10.1101/2022.03.02.22271697

Recopilado por Carlos Cabrera Lozada. Miembro Correspondiente Nacional, ANM puesto 16. ORCID: 0000-0002-3133-5183. 03/03/2022

Resumen

Las infecciones por SARS-CoV-2 a largo plazo en pacientes inmunodeficientes son una fuente importante de variación del virus, pero no se han estudiado lo suficiente. Se han publicado muchos estudios de casos que describen uno o un pequeño número de individuos infectados a largo plazo, pero ningún estudio ha combinado estas secuencias en un conjunto de datos cohesivo. Este trabajo tiene como objetivo rectificar esto y estudiar la genómica de este grupo de pacientes a través de una combinación de búsquedas bibliográficas e identificar nuevas series de casos directamente del conjunto de datos COG-UK. El dominio de unión al receptor del gen de la espiga (RBD) y los dominios N-terminales (NTD) se identificaron como puntos críticos de mutación. Se observó que surgían de forma recurrente numerosas mutaciones asociadas con variantes de interés. Además, una mutación en el gen de la envoltura, – Se determinó que T30I era la mutación más frecuente que se presentaba en infecciones persistentes. Una alta proporción de mutaciones recurrentes en individuos inmunodeficientes está asociada con la afinidad de ACE2, el escape inmunitario o la optimización del empaquetamiento viral. Existe una presión selectiva aparente para las mutaciones que ayudan a la transmisión dentro del huésped o la persistencia, que a menudo son diferentes de las mutaciones que ayudan a la transmisión entre huéspedes, aunque el hecho de que se consideren mutaciones de novo recurrentes múltiples que definen las variantes de interés indica claramente que este potencial fuente de nuevas variantes no debe descartarse.

Declaración de intereses en competencia

Los autores han declarado no tener intereses en competencia.

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