István Csabai, Krisztián Papp, Dávid Visontai et al. Unique SARS-CoV-2 variant found in public sequence data of Antarctic soil samples collected in 2018-2019, 22 December 2021, PREPRINT (Version 1) available at Research Square [https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-1177047/v1]
Recopilado por Carlos Cabrera Lozada. Miembro Correspondiente Nacional, ANM puesto 16. ORCID: 0000-0002-3133-5183. 30/12/2021
Resumen
La pandemia de COVID-19 lleva dos años ocurriendo y aunque se han planteado muchas hipótesis, su origen sigue siendo oscuro. Investigamos si las enormes muestras de los archivos de datos de secuenciación pública recopiladas antes de los primeros casos conocidos de la pandemia podrían contener rastros de SARS-CoV-2. Aquí informamos el análisis bioinformático de un conjunto de muestras de metagenoma recolectadas del suelo en la Isla Rey Jorge, Antártida entre 2018-12-24 y 2019-01-13. Contiene fragmentos de secuencia que coinciden con el genoma de referencia del SARS-CoV-2 con más de medio millón de nucleótidos, cubriendo el genoma completo en promedio 17×. El análisis preliminar de filogenia coloca la muestra cerca de los primeros casos conocidos. La alta cobertura de secuencia descarta alineaciones casuales de otras especies, pero no se puede excluir la posible contaminación de laboratorio. La secuencia alberga una combinación única de mutaciones, no vistas en otras muestras, por lo que cualquiera que sea su origen, puede agregar información importante al rompecabezas de la pandemia en curso.