Impactos clínicos y epidemiológicos de la secuenciación genómica completa sobre agentes bacterianos y virológicos

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Sarah Timsit, et al. https://doi.org/10.1016/j.idnow.2023.104844

Recopilado por Carlos Cabrera Lozada. Miembro Correspondiente Nacional, ANM puesto 16. ORCID: 0000-0002-3133-5183. 18/04/2024

Resumen 

La secuenciación del genoma completo (WGS) es una herramienta de biología molecular que consiste en la secuenciación del genoma completo de un organismo determinado. Debido a su capacidad para proporcionar la mejor resolución disponible de genética bacteriana y virológica, se utiliza en varios niveles en el campo de la infectología. A escala individual y mediante la aplicación de una única técnica, permite la identificación tipológica y caracterización de cepas, la caracterización de plásmidos y la búsqueda mejorada de genes de resistencia y factores de virulencia. A escala colectiva, permite la caracterización de cepas y la determinación de vínculos filogenéticos entre diferentes microorganismos durante brotes comunitarios y epidemias asociadas a la asistencia sanitaria. La información proporcionada por WGS permite el seguimiento en tiempo real de la epidemiología a nivel de cepa a escala mundial, y facilita la vigilancia de la diseminación de la resistencia y la introducción o aparición de variantes patógenas en los seres humanos o su entorno. Hay varios enfoques posibles para completar un genoma completo. La elección de un método en lugar de otro está dictada esencialmente por la matriz, ya sea una muestra clínica o un cultivo aislado, y el objetivo clínico. La secuenciación del genoma completo es una tecnología avanzada que sigue siendo costosa a pesar de la disminución gradual de sus gastos, lo que puede dificultar su implementación en ciertos laboratorios y, por lo tanto, su uso en microbiología de rutina. A pesar de que la secuenciación del genoma completo está avanzando constantemente como método de referencia, sigue siendo necesario realizar esfuerzos para armonizar sus interpretaciones y reducir el tiempo de generación de resultados concluyentes.

Academia Nacional de Medicina