Zerui Wang, Xin Cheng, Yibin Xu, Zhiyi Wang, Liyan Ma, Caiming Li, Shize Jiang, Yuchen Li, Shuilong Guo, Wenbin Du, Desvelando el microbioma de la neumonía neonatal mediante secuenciación de alto rendimiento y culturomics de gotas,
Genómica, proteómica y bioinformática , Volumen 23, Número 6, diciembre de 2025, qzaf047,
https://doi.org/10.1093/gpbjnl/qzaf047
Recopilado por Carlos Cabrera Lozada. Individuo de Número, ANM Sillón VII. ORCID: 0000-0002-3133-5183. 18/09/2026
Resumen
La neumonía neonatal es una de las principales causas de mortalidad infantil en todo el mundo; sin embargo, la falta de perfiles microbianos, especialmente de especies poco frecuentes, dificulta un diagnóstico preciso. Los métodos tradicionales pueden no capturar la complejidad de la microbiota respiratoria neonatal, ocultando así su papel en la progresión de la enfermedad. Aquí, describimos un enfoque novedoso que combina la secuenciación de alto rendimiento con el cultivo microfluídico basado en gotas para investigar los cambios en el microbioma de neonatos con neumonía. Mediante la secuenciación del gen del ARN ribosomal 16S (ARNr) de 71 casos de neumonía y 49 controles, identificamos 1009 géneros, incluyendo 930 taxones poco frecuentes, que mostraron diferencias compositivas significativas entre los grupos. El análisis discriminante lineal del tamaño del efecto identificó géneros clave asociados a la neumonía, como
Streptococcus ,
Rothia y
Corynebacterium . El cultivo basado en gotas recuperó 299 cepas de 94 taxones, incluyendo especies raras y patógenos ESKAPE, lo que respalda el manejo antimicrobiano dirigido. Los ensayos de interacción huésped-patógeno demostraron que
Rothia y
Corynebacterium inducen inflamación en las células epiteliales pulmonares, probablemente mediante la desregulación de la vía PI3K-Akt. La integración de estos taxones marcadores con factores clínicos, como la edad gestacional y el tipo de parto, ofrece la posibilidad de un diagnóstico y tratamiento precisos. La recuperación de diversas especies puede contribuir a la creación de un biobanco de microbiota respiratoria neonatal para impulsar estudios mecanísticos y estrategias terapéuticas.