CV. Evolución y escape de neutralización de la subvariante BA.2.86 del SARS-CoV-2

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Khadija Khan, et al. doi:https://doi.org/10.1101/2023.09.08.23295250

Recopilado por Carlos Cabrera Lozada. Miembro Correspondiente Nacional, ANM puesto 16. ORCID: 0000-0002-3133-5183. 25/09/2023

Resumen

La subvariante Ómicron BA.2.86 se diferencia de Ómicron BA.2, así como de las variantes que circulan recientemente, en más de 30 mutaciones solo en la proteína de pico. Aquí informamos sobre el primer aislamiento de la subvariante viva BA.2.86 de un hisopo de diagnóstico recolectado en Sudáfrica que analizamos para detectar anticuerpos neutralizantes y propiedades de replicación viral en cultivos celulares. BA.2.86 no tuvo significativamente más escape que Ómicron XBB.1.5 de la inmunidad neutralizante provocada por la infección de subvariantes de Ómicron que van desde BA.1 a XBB, ya sea por infección sola o como infección irruptiva en individuos vacunados. El escape de la neutralización estuvo presente en relación con cepas anteriores: BA.2.86 mostró un escape extenso tanto en relación con el virus ancestral en sueros de individuos vacunados antes de Ómicron como en relación con Ómicron BA.1 en sueros de Ómicron BA. 1 individuos infectados. No observamos diferencias sustanciales en las propiedades virales en cultivos celulares en relación con XBB.1.5. Tanto BA.2.86 como XBB.1.5 produjeron focos de infección de tamaño similar, tuvieron un efecto citopático similar (ambos más bajos que el SARS-CoV-2 ancestral) y tuvieron una dinámica de replicación similar. También investigamos la relación de las secuencias BA.2.86 con BA.2 y descubrimos que las más cercanas eran muestras de BA.2 del sur de África que circulaban a principios de 2022. Estas observaciones sugieren que BA.2.86 está más estrechamente relacionado con las secuencias del sur de África que otras. regiones y, por lo tanto, pueden haber evolucionado allí, y esa evolución llevó a escapar de anticuerpos neutralizantes similares en escala a las cepas de SARS-CoV-2 que circularon recientemente. 1.5 produjo focos de infección de tamaño similar, tuvo un efecto citopático similar (ambos más bajos que el SARS-CoV-2 ancestral) y tuvo una dinámica de replicación similar. También investigamos la relación de las secuencias BA.2.86 con BA.2 y descubrimos que las más cercanas eran muestras de BA.2 del sur de África que circulaban a principios de 2022. Estas observaciones sugieren que BA.2.86 está más estrechamente relacionado con las secuencias del sur de África que otras. regiones y, por lo tanto, pueden haber evolucionado allí, y esa evolución llevó a escapar de anticuerpos neutralizantes similares en escala a las cepas de SARS-CoV-2 que circularon recientemente. 1.5 produjo focos de infección de tamaño similar, tuvo un efecto citopático similar (ambos más bajos que el SARS-CoV-2 ancestral) y tuvo una dinámica de replicación similar. También investigamos la relación de las secuencias BA.2.86 con BA.2 y descubrimos que las más cercanas eran muestras de BA.2 del sur de África que circulaban a principios de 2022. Estas observaciones sugieren que BA.2.86 está más estrechamente relacionado con las secuencias del sur de África que otras. regiones y, por lo tanto, pueden haber evolucionado allí, y esa evolución llevó a escapar de anticuerpos neutralizantes similares en escala a las cepas de SARS-CoV-2 que circularon recientemente.