Aguilar-Ordoñez, I., Guzmán-Cerezo, E., Torres-Treviño, D. et al. Secuenciación completa del genoma de 1427 individuos mexicanos de la cohorte oriGen. Nat Commun (2026). https://doi.org/10.1038/s41467-026-77389-0
Recopilado por Carlos Cabrera Lozada. Individuo de Número, ANM Sillón VII. ORCID: 0000-0002-3133-5183. 07/09/2026
Resumen
Las poblaciones latinoamericanas siguen estando subrepresentadas en la investigación genómica. Para ayudar a abordar esto, presentamos un análisis de datos de genoma completo de alta cobertura de 1481 voluntarios reclutados como parte del Proyecto oriGen. Identificamos más de 47,2 millones de SNVs y 8,1 millones de shorts indels, incluyendo casi 3 millones de variantes cortas no singleton ausentes de dbSNP y del Estudio Prospectivo de Ciudad de México. El análisis de mezcla de admezcla indica que se necesita un conjunto de datos de entrenamiento mexicano para estimar con mayor precisión la composición ancestral por similitud genética. El análisis de la variación del número de copias asociada a MX-AMR destaca varios loci, incluyendo LCE1D y RHD. Curiosamente, mientras que el 3,1% de los participantes presentan deleciones homocigotas en el gen RHD, que determina el grupo sanguíneo Rh, esta frecuencia descendió al 0,6% entre individuos con MX-AMR alto. Dado que la deleción RHD es rara en asiáticos orientales, y el fenotipo Rh-negativo es raro en poblaciones indígenas americanas, nuestros resultados apoyan la hipótesis de que el grupo sanguíneo Rh-negativo aumentó en frecuencia durante la conquista española en lugar de por deriva genética. También encontramos que el 10% de los voluntarios son heterocigotos para la variante 22-42128945-C-T de pérdida de función en CYP2D6, una enzima implicada en el metabolismo de analgésicos, y tamoxifeno. Este trabajo ayuda a abordar la infrarrepresentación de poblaciones mexicanas en la investigación genómica.