CV. Actualización epidemiológica: Variantes de SARS-CoV-2 en la Región de las Américas

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Recopilado por Carlos Cabrera Lozada. Miembro Correspondiente Nacional, ANM puesto 16. ORCID: 0000-0002-3133-5183. 02/12/2021

Introducción

Desde diciembre de 2019 hasta el 30 de noviembre de 2021, más de 5,5 millones de secuencias genómicas completas del SARS-CoV-2 se han compartido en todo el mundo, a través de la plataforma GISAID1. La vigilancia genómica del SARS-CoV-2 provee información que permite monitorear la evolución del virus y contribuye en gran medida con la respuesta de salud pública a la pandemia de la COVID-19, dado que permite identificar tanto los cambios en los patrones epidemiológicos y de virulencia, como ajustar estrategias de prevención de la transmisión del virus. Actualmente, a nivel mundial y en la Región de las Américas se han identificado 5 variantes de preocupación (VOC, por sus siglas en inglés) Alfa, Beta, Gamma, Delta y más recientemente la VOC Ómicron, además de las variantes de interés (VOI, por sus siglas en inglés) Lambda y Mu (Figuras 1 y 2). Hasta el 30 de noviembre de 2021, de 839.119 secuencias cargadas a la plataforma GISAID a partir de muestras recolectadas en los últimos 60 días a nivel global, 837.253 (99,8%) fueron VOC Delta, 314 (<0,1%) VOC Gamma, 160 (<0,1%) VOC Alpha, 159 (<0,1%) VOC Ómicron, 14 (<0,1%) VOC Beta y <0,1% otras variantes circulantes (incluidaslas VOI Mu y Lambda). Se observa una distribución heterogénea a nivel subregional y nacional; más notablemente en algunos países de América del Sur, donde la dispersión de la VOC Delta ha sido más gradual, y otras variantes (por ejemplo, Gamma, Lambda y Mu) todavía contribuyen con una gran proporción de las secuencias informadas. En la República de Sudáfrica, donde se identificó inicialmente la VOC Ómicron, se ha observado un incremento reciente en el número de casos en múltiples provincias, coincidiendo con la detección de esta variante. Es importante mencionar que actualmente en la República de Sudáfrica se encuentran circulando todas las VOC, con predominio de la VOC Ómicron en las últimas dos semanas.

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