CV. B.1.1.529 escapa a la mayoría de los anticuerpos neutralizantes del SARS-CoV-2 de diversos epítopos

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Yunlong Richard Cao, et al. doi: https://doi.org/10.1101/2021.12.07.470392

Recopilado por Carlos Cabrera Lozada. Miembro Correspondiente Nacional, ANM puesto 16. ORCID: 0000-0002-3133-5183. 10/12/2021

Resumen

La variante del SARS-CoV-2 B.1.1.529 (Omicron) contiene 15 mutaciones en el dominio de unión al receptor (RBD). Cómo Omicron evadiría los anticuerpos neutralizantes de RBD (NAbs) y la inmunidad humoral requiere una investigación inmediata. Aquí, utilizamos la detección de muestras de levadura de alto rendimiento para determinar los perfiles de mutación de escape de RBD para 247 NAbs humanos anti-RBD identificados a partir de convalecientes y vacunados de SARS-CoV / SARS-CoV-2. Sobre la base de los resultados, los NAbs podrían agruparse sin supervisión en seis grupos de epítopos (A-F), lo que es altamente concordante con las clasificaciones estructurales basadas en el conocimiento. Sorprendentemente, varias mutaciones individuales de Omicron podrían afectar a los NAbs de diferentes grupos de epítopos. Específicamente, los NAbs en el Grupo A-D, cuyo epítopo se superpone con el motivo de unión a ACE2, son escapados en gran medida por K417N, N440K, G446S, E484A, Q493K y G496S. Los NAbs del grupo E (sitio S309) y F (sitio CR3022), que a menudo exhiben una amplia actividad neutralizante del sarbecovirus, se ven menos afectados por Omicron, pero aún así, un subconjunto de NAbs son escapados por G339D, S371L y S375F. Además, la neutralización del pseudovirus B.1.1.529 y el ensayo de unión a RBD mostraron que la mutación única que tolera los NAbs también podría escaparse debido a múltiples mutaciones sinérgitas en sus epítopos. En total, más del 85% de los NAbs probados son escapados por Omicron. Con respecto a los medicamentos NAb, el cóctel LY-CoV016 / LY-CoV555, el cóctel REGN-CoV2, el cóctel AZD1061 / AZD8895 y BRII-196 fueron escapados por Omicron, mientras que VIR7831 y DXP-604 todavía funcionan con una eficacia reducida. En conjunto, los datos sugieren que Omicron podría causar una evasión inmune humoral significativa, mientras que los NAbs dirigidos a la región conservada por sarbecovirus siguen siendo los más efectivos. Nuestros resultados ofrecen instrucciones para desarrollar medicamentos y vacunas NAb contra Omicron y futuras variantes.

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