Secuenciación del genoma completo para la evaluación prenatal de anomalías estructurales fetales: un estudio multicéntrico prospectivo

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Zhi Gao , et al. DOI: 10.1016/j.ajog.2025.08.025

Recopilado por Carlos Cabrera Lozada. Individuo de Número, ANM Sillón VII. ORCID: 0000-0002-3133-5183. 13/01/2026

Resumen

Fondo

La validez clínica de la secuenciación del genoma completo en entornos posnatales está bien documentada, pero los estudios sobre su uso en entornos prenatales son limitados.

Objetivo

El objetivo de este estudio fue evaluar prospectivamente el desempeño de la secuenciación del genoma completo para el diagnóstico prenatal de anomalías estructurales fetales en comparación con la estrategia de prueba comúnmente utilizada de secuenciación de variantes del número de copias más secuenciación del exoma.

Diseño del estudio

Se realizó la secuenciación completa del genoma en paralelo con la secuenciación de variantes en el número de copias y la secuenciación del exoma de 96 tríos progenitor-feto con anomalías estructurales fetales. Las variantes de un solo nucleótido, las pequeñas inserciones/deleciones, las variaciones en el número de copias, las variantes estructurales y la ausencia de heterocigosidad se clasificaron según las directrices del Colegio Americano de Genética Médica y Genómica, la Asociación de Patología Molecular y ClinGen.

Resultados

Las variantes diagnósticas se encontraron mediante secuenciación de variantes de número de copias para 5/96 (5,2%) fetos y mediante secuenciación de trío-exoma para 26/96 (27,1%) fetos. La tasa de diagnóstico combinada para la secuenciación de variantes de número de copias más la secuenciación de trío-exoma fue 30/96 (31,2%). La secuenciación del genoma completo identificó todas las variantes diagnósticas detectadas por secuenciación de variantes de número de copias y secuenciación de trío-exoma más 3 fetos adicionales (uno con disomía 15 uniparental materna, uno con un reordenamiento cromosómico complejo y uno con variantes heterocigotas compuestas de un solo nucleótido en NADSYN1 ), lo que aumentó la tasa de diagnóstico a 33/96 (34,4%). La tasa de diagnóstico más alta se observó en fetos con anomalías craneofaciales (2/3, 66,7%), seguido de aquellos con hidropesía (3/6, 50,0%). Se detectaron diez familias (10,5%, 10/96) con hallazgos incidentales, de las cuales, las variantes estructurales en 7 fetos se detectaron solo mediante secuenciación del genoma completo, incluidas 6 inversiones y una disomía uniparental 16.

Conclusión

La secuenciación del genoma completo basada en trío ofrece una alternativa válida a la secuenciación de variantes del número de copias más la secuenciación del exoma, lo que demuestra la capacidad para un análisis genómico más completo de fetos con anomalías estructurales y al mismo tiempo permite la consolidación de los flujos de trabajo de laboratorio en una sola prueba.