Lindeboom, RGH, Worlock, KB, Dratva, LM et al. El desafío humano con SARS-CoV-2 revela dinámicas de respuesta locales y sistémicas. Nature 631 , 189–198 (2024). https://doi.org/10.1038/s41586-024-07575-x
Recopilado por Carlos Cabrera Lozada. Miembro Correspondiente Nacional, ANM puesto 16. ORCID: 0000-0002-3133-5183. 22/07/2024
Resumen
La pandemia de COVID-19 es una amenaza mundial para la salud, pero nuestra comprensión de la dinámica de las respuestas celulares tempranas a esta enfermedad sigue siendo limitada 1 . Aquí, en nuestro estudio de desafío humano con SARS-CoV-2, utilizamos el perfil multiómico de células individuales de hisopos nasofaríngeos y sangre para resolver temporalmente las infecciones abortivas, transitorias y sostenidas en individuos seronegativos desafiados con pre-Alpha SARS-CoV-2. Nuestros análisis revelaron cambios rápidos en las proporciones de tipo celular y docenas de estados de respuesta celular altamente dinámicos en células epiteliales e inmunes asociadas con puntos temporales específicos y estado de infección. Observamos que la respuesta del interferón en la sangre precedió a la respuesta nasofaríngea. Además, la infiltración inmune nasofaríngea ocurrió temprano en muestras de individuos con solo infección transitoria y más tarde en muestras de individuos con infección sostenida. La alta expresión de HLA-DQA2 antes de la inoculación se asoció con la prevención de la infección sostenida. Las células ciliadas mostraron múltiples respuestas inmunitarias y fueron las más permisivas para la replicación viral, mientras que las células T nasofaríngeas y los macrófagos se infectaron de forma no productiva. Resolvimos 54 estados de células T, incluidas las células T activadas de forma aguda que se expandieron clonalmente mientras portaban motivos convergentes del SARS-CoV-2. Nuestro nuevo proceso computacional Cell2TCR identifica las células T activadas que responden a antígenos en función de una firma de expresión genética y las agrupa en grupos y motivos de clonotipos. En general, nuestros datos detallados de series temporales pueden servir como una piedra de Rosetta para las respuestas de las células epiteliales e inmunitarias y revelan respuestas dinámicas tempranas asociadas con la protección contra la infección.