El análisis de 125 pacientes hospitalizados con COVID-19 reveló que aunque las células T CD4 y CD8 se activaron en algunos pacientes, las respuestas de las células T fueron limitadas en otros. En muchos pacientes, la proliferación de células T CD4 y CD8 (medida por el aumento de KI67) y la activación (detectada por la coexpresión de CD38 y HLA-DR) fueron consistentes con las respuestas antivirales observadas en otras infecciones. Las respuestas de plasmablast (PB) estuvieron presentes en muchos pacientes, alcanzando> 30% de las células B totales, y la mayoría de los pacientes produjeron anticuerpos específicos contra el SARS-CoV-2. Sin embargo, ~ 20% de los pacientes tenían poca activación de células T o respuesta PB en comparación con los controles. En algunos pacientes, las respuestas disminuyeron con el tiempo, asemejándose a la cinética típica de las respuestas antivirales; en otros, sin embargo, las respuestas robustas de células T y PB permanecieron estables o aumentaron con el tiempo. Estos patrones temporales se asociaron con características clínicas específicas. Con un enfoque de proyección y aproximación múltiple uniforme imparcial (UMAP), destilamos ~ 200 parámetros inmunes en dos componentes principales de la respuesta inmunitaria y un tercer patrón que carece de respuestas inmunes adaptativas robustas, revelando así los inmunotipos de COVID-19: (i) El inmunotipo 1 se asoció con la gravedad de la enfermedad y mostraron células T CD4 activadas robustas, escasez de células auxiliares foliculares circulantes, «EMRA» CD8 activadas, células T CD8 hiperactivadas o agotadas y PB. (ii) El inmunotipo 2 se caracterizó por una menor activación de células T CD4, células T CD4 y CD8 efectoras Tbet + y células B de memoria en proliferación y no se asoció con la gravedad de la enfermedad. (iii) También se identificó el inmunotipo 3, que se correlacionó negativamente con la gravedad de la enfermedad y carecía de respuestas obvias de células T y B activadas. La mortalidad ocurrió en pacientes con los tres inmunotipos, lo que ilustra una relación compleja entre la respuesta inmune y COVID-19.
CONCLUSIÓN. Se identificaron tres inmunotipos que revelan diferentes patrones de respuestas de linfocitos en pacientes hospitalizados con COVID-19. Estos tres patrones principales pueden representar cada uno una respuesta subóptima diferente asociada con la hospitalización y la enfermedad. Nuestros hallazgos pueden tener implicaciones para los tratamientos enfocados en activar versus inhibir la respuesta inmune.