Baker, S.J.C., Nfonsam, L.E., Leto, D. et al. La infección crónica por COVID-19 en un paciente inmunodeprimido muestra cambios en el linaje a lo largo del tiempo: informe de un caso. Virol J 21, 8 (2024). https://doi.org/10.1186/s12985-023-02278-7
Recopilado por Carlos Cabrera Lozada. Miembro Correspondiente Nacional, ANM puesto 16. ORCID: 0000-0002-3133-5183. 05/01/2024
Resumen
La pandemia de COVID-19, causada por el virus del coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo severo, surgió a finales de 2019 y se extendió por todo el mundo. Todavía se desconocen muchos de los efectos de la infección por este patógeno, ya que tanto la infección crónica como la repetida por COVID-19 producen nuevas patologías.
Presentación del caso
Paciente inmunodeprimido que presentó infección crónica por COVID-19. El paciente tenía antecedentes de linfoma de Hodgkin, tratado con quimioterapia y trasplante de células madre. Durante el transcurso de su tratamiento, se analizaron once muestras respiratorias del paciente mediante secuenciación del genoma completo seguida de identificación del linaje. La secuenciación del genoma completo del virus presente en el paciente a lo largo del tiempo reveló que el paciente albergaba en varios momentos tres linajes diferentes del virus. El paciente se infectó inicialmente con el linaje B.1.1.176 antes de la coinfección con BA.1. Cuando el paciente se coinfectó con B.1.1.176 y BA.1, las poblaciones virales se encontraron en proporciones aproximadamente iguales dentro del paciente según la abundancia de lecturas de secuenciación. Tras un muestreo adicional, se encontró que el linaje presente en el paciente durante los dos últimos puntos de tiempo era BA.2.9. El paciente finalmente desarrolló insuficiencia respiratoria y murió.
Conclusiones
Este estudio de caso muestra un ejemplo de los cambios que pueden ocurrir dentro de un paciente inmunodeprimido que se infecta con COVID-19 varias veces. Además, este caso demuestra cómo la coinfección simultánea con dos linajes de COVID-19 puede conducir a una asignación de linajes poco clara mediante métodos estándar, que se resuelven con una investigación adicional. Al analizar los casos de infección y reinfección crónica por COVID-19, se debe tener cuidado de identificar adecuadamente los linajes del virus presente.
Puntos clave
- Un paciente dio positivo repetidamente por COVID-19 durante 16 meses.
- La infección progresó de un linaje a la coinfección con un segundo linaje, antes de la eliminación de la coinfección y la reinfección con un tercer linaje diferente.
- La coinfección fue difícil de identificar a través de métodos genómicos.