El estado de Amazonas, en el norte de Brasil, es una de las regiones más afectadas por la epidemia de COVID-19 y experimentó dos oleadas de crecimiento exponencial a principios y finales de 2020. A través de un estudio de epidemiología genómica basado en 250 genomas de SARS-CoV-2 de diferentes municipios En marzo de 2020 y enero de 2021 revelamos que la primera fase de crecimiento exponencial fue impulsada principalmente por la diseminación del linaje B.1.195 que fue reemplazado gradualmente por el linaje B.1.1.28. La segunda ola coincide con el surgimiento de la variante de preocupación (VOC) P.1 que evolucionó de un clado local B.1.1.28 a fines de noviembre y reemplazó rápidamente al linaje parental en menos de dos meses. Nuestros hallazgos apoyan que los reemplazos sucesivos de linajes en Amazonas fueron impulsados por una combinación compleja de niveles variables de medidas de distanciamiento social y la aparición de un virus VOC P.1 más transmisible. Estos datos brindan información única para comprender los mecanismos que subyacen a las ondas epidémicas de COVID-19 y el riesgo de diseminación del SARS-CoV-2 VOCP.1 en Brasil y potencialmente en todo el mundo.
