Ahmed Barghee, et al. DOI: 10.1016/j.ebiom.2025.105630
Recopilado por Carlos Cabrera Lozada. Individuo de Número, ANM Sillón VII. ORCID: 0000-0002-3133-5183. 17/04/2025
Resumen
La microbiota intestinal de los lactantes alberga una mayor proporción de genes de resistencia a los antibióticos (ARG) en comparación con la de los adultos, incluso en lactantes que nunca han estado expuestos a antibióticos. Nuestro estudio pretende dilucidar este fenómeno mediante el análisis de cómo diferentes factores perinatales influyen en la presencia de ARG, elementos genéticos móviles (MGE) y sus hospedadores bacterianos en el intestino del lactante.
Métodos
Se realizaron búsquedas en MEDLINE y Embase hasta el 3 de abril de 2023 para encontrar estudios que informaran sobre cohortes infantiles con secuenciación metagenómica shotgun de muestras de heces. La búsqueda sistemática identificó 14 cohortes infantiles longitudinales de 10 países en tres continentes, con datos de secuenciación pública y sus metadatos correspondientes. Para los análisis bioinformáticos integrativos posteriores, se utilizaron 3981 muestras metagenómicas de alta calidad de 1270 bebés y 415 madres.
Recomendaciones
Identificamos trayectorias distintas del resistoma y el mobiloma asociadas con el modo de nacimiento, la edad gestacional, el uso de antibióticos y la ubicación geográfica. La variación geográfica se ejemplificó mediante las diferencias entre cohortes de Europa, África meridional y América del Norte, que mostraron variación tanto en la diversidad como en la abundancia de ARG. Por otro lado, no detectamos un impacto significativo de la lactancia materna en el resistoma intestinal de los lactantes. Más de la mitad de los ARG detectados se co-localizaron con plásmidos en huéspedes bacterianos clave, como Escherichia coli y Enterococcus faecalis . Estos plásmidos asociados a ARG se perdieron gradualmente durante la infancia. También demostramos que el papel de E. coli como modulador primario del resistoma y el mobiloma intestinal del lactante se ve facilitado por su mayor abundancia y diversidad de cepas en comparación con los adultos.
Interpretación
El modo de nacimiento, la edad gestacional, la exposición a antibióticos y la ubicación geográfica influyen significativamente en el desarrollo del resistoma y el moviloma intestinal del lactante. La reducción de la abundancia relativa de E. coli con el tiempo parece ser un factor clave que impulsa la disminución de la abundancia relativa tanto del resistoma como del plásmido a medida que los lactantes crecen.