Harley, John B et al. «Los factores de transcripción operan a través de loci de la enfermedad, con EBNA2 implicado en la autoinmunidad». Genética de la naturaleza Vol. 50,5 (2018): 699-707. DOI: 10.1038/s41588-018-0102-3
Recopilado por Carlos Cabrera Lozada. Miembro Correspondiente Nacional, ANM puesto 16. ORCID: 0000-0002-3133-5183. 27/09/2023
Resumen
Explicar la genética de muchas enfermedades es un desafío porque la mayoría de las asociaciones se localizan en regiones reguladoras caracterizadas de manera incompleta. Usando nuevos métodos computacionales, mostramos que los factores de transcripción (TF) ocupan múltiples loci asociados con trastornos genéticos complejos individuales. La aplicación a 213 fenotipos y 1.544 conjuntos de datos de unión de TF identificó 2.264 relaciones entre cientos de TF y 94 fenotipos, incluido el receptor de andrógenos en el cáncer de próstata y GATA3 en el cáncer de mama. Sorprendentemente, casi la mitad de los loci de riesgo de lupus eritematoso sistémico están ocupados por la proteína EBNA2 del virus de Epstein-Barr y muchos TF humanos coagrupados, que muestran interacción gen-ambiente. Existen asociaciones similares ancladas a EBNA2 en la esclerosis múltiple, la artritis reumatoide, la enfermedad inflamatoria intestinal, la diabetes tipo 1, la artritis idiopática juvenil y la enfermedad celíaca. Los casos de unión al ADN dependiente de alelos y los efectos posteriores sobre la expresión génica en variantes plausiblemente causales apoyan los mecanismos genéticos dependientes de EBNA2. Nuestros resultados nominan mecanismos que operan a través de loci de riesgo dentro de los fenotipos de la enfermedad, lo que sugiere nuevos modelos para los orígenes de la enfermedad.