Secuenciación genómica y análisis de un nuevo virus de la viruela bovina humana con secuencias de mosaico de América del Norte y el Ortopoxvirus del Viejo Mundo

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Diana Díaz-Cánova1et al. Frente. Microbiol., 03 de mayo de 2022 | https://doi.org/10.3389/fmicb.2022.868887

Recopilado por Carlos Cabrera Lozada. Miembro Correspondiente Nacional, ANM puesto 16 . ORCID: 0000-0002-3133-5183. 21/05/2022

Resumen

Los orthopoxvirus (OPXV) no solo infectan a sus huéspedes naturales, sino que algunos OPXV también pueden causar enfermedades en los seres humanos. Anteriormente, caracterizamos parcialmente un OPXV aislado de un hombre de 18 años que vivía en el norte de Noruega. El análisis de enzimas de restricción y la secuenciación parcial del genoma caracterizaron a este virus como un virus atípico de la viruela bovina (CPXV), al que denominamos CPXV-No-H2. En este estudio, determinamos la secuencia completa del genoma de CPXV-No-H2 utilizando la secuenciación de Illumina y Nanopore. Nuestros resultados mostraron que todo el genoma CPXV-No-H2 tiene una longitud de 220.276 pares de bases (pb), con regiones de repetición terminales invertidas de aproximadamente 7 kbp, que contienen 217 genes predichos. Diecisiete proteínas CPXV-No-H2 predichas eran más similares a las proteínas OPXV del Viejo Mundo, incluyendo el virus Ectromelia (ECTV) y el virus Vaccinia, y América del Norte, el virus de la viruela de Alaska (AKPV). CPXV-No-H2 tiene un genoma en mosaico con genes más similares a otros genes OPXV, y se identificaron siete eventos potenciales de recombinación. El análisis filogenético mostró que CPXV-No-H2 formó un clado separado con los aislados cpXV alemanes CPXV_GerMygEK938_17 y CPXV_Ger2010_MKY, compartiendo una identidad de nucleótido del 96,4 y 96,3%, respectivamente, y este clado se agrupó estrechamente con el clado ECTV-OPXV Abatino. CPXV-No-H2 es un virus del mosaico que puede haber surgido de varios eventos de recombinación entre OPXV, y su agrupación filogenética sugiere que los virus de la viruela bovina similares a ECTV-Abatino forman un nuevo clado distinto de virus de la viruela bovina.

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