Ralf Dürr, et al. DOI: https://doi.org/10.1016/j.ebiom.20
Recopilado por Carlos Cabrera Lozada. Miembro Correspondiente Nacional, ANM puesto 16. ORCID: 0000-0002-3133-5183. 07/11/2023
Resumen
Las altas tasas de vacunación e infección natural impulsan la inmunidad y redirigen la adaptación viral selectiva. Se instalan refuerzos actualizados para hacer frente a los virus a la deriva, pero faltan datos sobre la evolución adaptativa bajo una presión inmune creciente en una situación del mundo real.
Métodos
Estudio transversal para caracterizar la dinámica mutacional del SARS-CoV-2 y la adaptación selectiva durante >1 año en relación con el estado de la vacuna, la filogenética viral y las variables clínicas y demográficas asociadas.
Recomendaciones
El estudio de >5400 infecciones por SARS-CoV-2 entre julio de 2021 y agosto de 2022 en el área metropolitana de Nueva York retrató la transición evolutiva de las variantes Delta a Ómicron BA.1-BA.5. Las vacunas de refuerzo se implementaron durante la ola Delta, pero las infecciones irruptivas de refuerzo y las reinfecciones por SARS-CoV-2 fueron casi exclusivas de Ómicron. En los análisis de regresión logística ajustados, BA.1, BA.2 y BA.5 tuvieron una ventaja de crecimiento significativa sobre los linajes concurrentes en la población impulsada, a diferencia de BA.2.12.1 o BA.4. La presión de selección mediante inyecciones de refuerzo se tradujo en una evolución adaptativa difusa en el pico Delta, en contraste con una fuerte evolución adaptativa centrada en motivos de unión al receptor en el pico BA.2-BA.5 (pruebas exactas de Fisher; tasas de mutación sinónimas/no sinónimas por sitio) . La evolución convergente se ha vuelto común en Ómicron , involucrando posiciones de picos cruciales para el escape inmunológico, la unión al receptor o la escisión.
Interpretación
Se requieren inyecciones de refuerzo para hacer frente a las deficiencias en la inmunidad. Su presión inmune discriminativa contribuye a su eficacia, pero también requiere un seguimiento de los procesos de adaptación viral selectiva. Ómicron BA.2 y BA.5 tuvieron una ventaja selectiva bajo la presión de la vacunación de refuerzo, lo que contribuyó a la evolución de los sublinajes BA.2 y BA.5 y las formas recombinantes que predominarán en 2023.