CV. Diversidad genética del SARS-CoV-2 en Venezuela: Predominio de las Variantes D614G y Análisis de un Brote. PLOS ONE, 19/02/2021

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Carmen L. Loureiro, Rossana C. Jaspe, Pierina D´Angelo, José L. Zambrano, Lieska Rodriguez, Víctor Alarcon, Mariangel Delgado, Marwan Aguilar, Domingo Garzaro, Héctor R. Rangel, Flor H. Pujol.

El SARS-CoV-2 es el nuevo coronavirus responsable de la enfermedad COVID-19. Los dos primeros casos de COVID-19 fueron detectados en Venezuela el 13 de marzo de 2020. El objetivo de este estudio fue la caracterización genética de aislados de SARS-CoV-2 venezolanos. Se obtuvieron un total de 7 secuencias completas del genoma del SARS-CoV-2 por secuenciación de Sanger, de pacientes de diferentes regiones de Venezuela, principalmente desde el inicio de la epidemia. Diez de los 11 aislamientos (6 genomas completos y 4 regiones genómicas de pico parcial) pertenecían al linaje B, y tenían la mutación D614G en la proteína Spike. Los aislamientos del primer brote que ocurrió en la Isla de Margarita albergaron una deleción en marco en su secuencia, sin los aminoácidos 83–85 del NSP1 del ORF1. La búsqueda de deleciones en 48.635 secuencias mostró que el gen NSP1 presenta la mayor frecuencia de deleciones a lo largo de todo el genoma. El análisis estructural sugiere un cambio en el dominio N-terminal con la presencia de esta deleción. Por el contrario, los aislamientos que circulan más tarde en esta isla carecían de la eliminación, lo que sugiere nuevas introducciones en la isla después de este primer brote. En conclusión, se encontró una alta diversidad de aislados de SARS-CoV-2 circulando en Venezuela, con predominio de la mutación D614G. El primer brote pequeño en la isla de Margarita pareció estar asociado con una cepa que portaba una pequeña deleción en la proteína NSP1, pero estos aislados no parecen ser responsables del brote más grande que comenzó en julio.

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