Alexander Crits-Christoph, et al. DOI: 10.1016/j.cell.2024.08.010
Recopilado por Carlos Cabrera Lozada. Miembro Correspondiente Nacional, ANM puesto 16. ORCID: 0000-0002-3133-5183. 22/09/2024
Resumen
•El ancestro común del SARS-CoV-2 vinculado al mercado de Huanan coincide con el ancestro común mundial
•Identifican ADN mitocondrial de fauna silvestre en muestras de establos positivos para SARS-CoV-2
•ADN de perros mapache, civetas y otras especies de vida silvestre detectadas en muestras de mercado
•Se reconstruyeron los genotipos de los huéspedes potenciales para rastrear los orígenes geográficos de los animales
Se han producido efectos zoonóticos de virus a través del comercio de animales en todo el mundo. El inicio de la pandemia de COVID-19 se remonta epidemiológicamente al mercado mayorista de mariscos de Huanan. Aquí, analizamos los datos ambientales de qPCR y secuenciación recopilados en el mercado de Huanan a principios de 2020. Demostramos que la diversidad genética del coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo severo ligado al mercado (SARS-CoV-2) es consistente con la emergencia del mercado y encontramos un aumento de la positividad del SARS-CoV-2 cerca y dentro de un puesto de vida silvestre. Identificamos ADN de vida silvestre en todas las muestras positivas para SARS-CoV-2 de este puesto, incluidas especies como civetas, ratas de bambú y perros mapache, identificados previamente como posibles huéspedes intermediarios. También detectamos virus animales que infectan a perros mapache, civetas y ratas de bambú. Combinando enfoques metagenómicos y filogenéticos, recuperamos genotipos de animales de mercado y los comparamos con los de granjas y otros mercados. Este análisis proporciona la base genética para una lista corta de posibles huéspedes intermedios del SARS-CoV-2 para priorizar el muestreo serológico y viral.