CV. La recuperación de los datos de secuenciación profunda eliminados arroja más luz sobre la epidemia temprana de SARS-CoV-2 en Wuhan

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Jesse D Bloom, Recovery of deleted deep sequencing data sheds more light on the early Wuhan SARS-CoV-2 epidemic, Molecular Biology and Evolution, 2021;, msab246, https://doi.org/10.1093/molbev/msab246

Recopilado por Carlos Cabrera Lozada. Director del postgrado de Medicina Materno Fetal. Universidad Central de Venezuela. ORCID: 0000-0002-3133-5183. 17/08/2021

Resumen

El origen y la propagación temprana del SARS-CoV-2 sigue envuelto en el misterio. Aquí identifico un conjunto de datos que contiene secuencias de SARS-CoV-2 de principios de la epidemia de Wuhan que se ha eliminado del Archivo de Lectura de Secuencias de los NIH. Recupero los archivos eliminados de Google Cloud y reconstrujo secuencias parciales de 13 virus epidémicos tempranos. El análisis filogenético de estas secuencias en el contexto de datos existentes cuidadosamente anotados apoya aún más la idea de que las secuencias del mercado de mariscos de Huanan no son totalmente representativas de los virus en Wuhan al principio de la epidemia. En cambio, el progenitor de las secuencias de SARS-CoV-2 actualmente conocidas probablemente contenía tres mutaciones en relación con los virus del mercado que lo hacían más similar a los parientes de coronavirus de murciélagos del SARS-CoV-2.

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