CV. Perfiles comparativos de ARNm subgenómico de los sublinajes SARS-CoV-2 Alfa, Delta y Ómicron BA.1, BA.2 y BA.5 utilizando datos daneses de vigilancia genómica de COVID-19

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Man-Hung Eric Tang, et al. DOI:https://doi.org/10.1016/j.ebiom.2023.104669

Recopilado por Carlos Cabrera Lozada. Miembro Correspondiente Nacional, ANM puesto 16. ORCID: 0000-0002-3133-5183. 28/08/2023 

Resumen

El coronavirus-2 del síndrome respiratorio agudo severo (SARS-CoV-2) se ha propagado rápidamente en todo el mundo en la población desde que se detectó por primera vez a fines de 2019. La transcripción y replicación de los coronavirus, aunque no se comprende completamente, se caracteriza por la producción de ARN de longitud genómica y ARN subgenómicos más cortos para producir proteínas virales y, en última instancia, viriones de progenie. Los niveles observados de ARN subgenómicos difieren entre los sublinajes y los marcos de lectura abiertos, pero su importancia biológica actualmente no está clara.

Métodos

Utilizando un panel grande y diverso de datos de secuenciación de virus producidos como parte de la vigilancia rutinaria danesa de COVID-19 junto con información en registros electrónicos de salud, evaluamos la asociación de los niveles de ARN subgenómico con variables demográficas y clínicas de los individuos infectados.

Resultados

Nuestros hallazgos sugieren que no hay una relación estadística significativa entre los niveles de ARN subgenómicos y los factores relacionados con el huésped.

Interpretación

Las diferencias entre linajes y ORFs subgenómicos pueden estar relacionadas con diferencias en el tropismo de las células diana, la cinética temprana de replicación/transcripción del virus o las características de la secuencia.

Academia Nacional de Medicina