Secuencias de ADN mitocondrial nuclearmente incrustadas en 66.083 genomas humanos

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Wei, W., Schon, K.R., Elgar, G. et al. Secuencias de ADN mitocondrial nuclearmente incrustadas en 66.083 genomas humanos. Naturaleza (2022). https://doi.org/10.1038/s41586-022-05288-7

Recopilado por  José Luis Cevallos González. Miembro Correspondiente Nacional, ANM puesto 4. 8/10/2022

Resumen

La transferencia de ADN de los orgánulos citoplasmáticos al núcleo celular es un legado del evento endosimbiótico: se cree que la mayoría de los segmentos nuclear-mitocondriales (CST) son antiguos, precediendo a la especiación humana.1,2,3. Aquí analizamos secuencias de genoma completo de 66,083 personas, incluidas 12,509 personas con cáncer, y demostramos la transferencia continua de ADN mitocondrial al núcleo, lo que contribuye a un panorama NUMT complejo. Más del 99% de los individuos tenían al menos uno de los 1.637 TNMT diferentes, y 1 de cada 8 individuos tenía un TNM ultra raro que está presente en menos del 0,1% de la población. Más del 90% de los CNT existentes que evaluamos se insertaron en el genoma nuclear después de que los humanos divergieron de los simios. Una vez incrustadas, las secuencias ya no estaban bajo la restricción evolutiva observada dentro de la mitocondria, y las mutaciones específicas de NUMT tenían una firma mutacional diferente al ADN mitocondrial. Se observaron NUMT de novo en la línea germinal una vez cada 104 nacimientos y una de cada 103 Cánceres. Los NUMT involucraron preferentemente ADN mitocondrial no codificante, vinculando la transcripción y la replicación a su origen, con la inserción nuclear que involucra múltiples mecanismos, incluida la reparación de rotura de doble cadena asociada con la unión a la proteína 9 del dedo de zinc del dominio PR (PRDM9). La frecuencia de los TNM específicos del tumor difirió entre los cánceres, incluida una inserción probablemente causal en un liposarcoma mixoide. Encontramos evidencia de selección contra NUMTs sobre la base del tamaño y la ubicación genómica, dando forma a un paisaje NUMT humano altamente heterogéneo y dinámico.

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